Badan Eksekutif Mahasiswa (BEM) adalah organisasi kemahasiswaan yang merupakan lembaga eksekutif tertinggi di Poltekkes BSI. Dalam melaksanakan program kerjanya, BEM berada dibawah pembinaan dan berkoordinasi dengan Wakil Direktur III dan bagian kemahasiswaan. BEM bertugas melaksanakan segala ketetapan dalam AD dan ART BEM Poltekkes BSI, serta mewakili mahasiswa Poltekkes BSI dalam berbagai kegiatan mahasiswa di dalam maupun luar kampus.